Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms