Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TROQ12816 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TROQ12816 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROQ12816 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TROQ12816 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TROQ12816 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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