Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms