Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms