Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms