Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms