Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms