Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms