Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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