Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms