Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP9P55211 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms