Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms