Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCL1P53675 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms