Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms