Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms