Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NESP48681 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NESP48681 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NESP48681 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NESP48681 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NESP48681 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NESP48681 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NESP48681 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NESP48681 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NESP48681 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NESP48681 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NESP48681 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NESP48681 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
NESP48681 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms