Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms