Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms