Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6P35125 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6P35125 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6P35125 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6P35125 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
USP6P35125 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms