Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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