Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TYMSP04818 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TYMSP04818 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms