Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT4O95628 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms