Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SFT2D2O95562 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms