Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms