Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms