Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms