Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRODHO43272 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRODHO43272 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRODHO43272 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms