Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRPO00591 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRPO00591 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRPO00591 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRPO00591 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRPO00591 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRPO00591 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms