Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C2AO00443 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3C2AO00443 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms