Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms