Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms