Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gdf11Q9Z1W4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gdf11Q9Z1W4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdf11Q9Z1W4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdf11Q9Z1W4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gdf11Q9Z1W4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms