Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pard6aQ9Z101 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pard6aQ9Z101 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pard6aQ9Z101 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pard6aQ9Z101 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pard6aQ9Z101 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms