Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scnn1gQ9WU39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1gQ9WU39 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1gQ9WU39 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1gQ9WU39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms