Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp18Q9WTV6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp18Q9WTV6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp18Q9WTV6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms