Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PADI1Q9ULC6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI1Q9ULC6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI1Q9ULC6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms