Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NumbQ9QZS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NumbQ9QZS3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NumbQ9QZS3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NumbQ9QZS3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NumbQ9QZS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NumbQ9QZS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NumbQ9QZS3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NumbQ9QZS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NumbQ9QZS3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NumbQ9QZS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms