Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc9Q8VC31 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc9Q8VC31 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc9Q8VC31 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc9Q8VC31 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms