Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc3Q8CFZ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc3Q8CFZ4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc3Q8CFZ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms