Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYT9Q86SS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT9Q86SS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT9Q86SS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms