Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mfsd4aQ6PDC8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd4aQ6PDC8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd4aQ6PDC8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4aQ6PDC8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms