Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcf2lQ64096 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcf2lQ64096 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mcf2lQ64096 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms