Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1eQ61290 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1eQ61290 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1eQ61290 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms