Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PfasQ5SUR0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PfasQ5SUR0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PfasQ5SUR0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PfasQ5SUR0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms