Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srbd1Q497V5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srbd1Q497V5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srbd1Q497V5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srbd1Q497V5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srbd1Q497V5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms