Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc185Q3V118 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc185Q3V118 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc185Q3V118 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc185Q3V118 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc185Q3V118 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms