Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn4Q3UWL8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn4Q3UWL8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn4Q3UWL8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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