Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 HMS2YJR147W 1077 nt6.36□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 YKR032WYKR032W 315 nt6.35□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 YML122CYML122C 381 nt6.35□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 YJR107WYJR107W 987 nt6.34□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 ATP23YNR020C 813 nt6.34□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 DAL4YIR028W 1908 nt6.34□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 YHR131CYHR131C 2553 nt6.34□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 GDH1YOR375C 1365 nt6.33□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 MPE1YKL059C 1326 nt6.33□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YPQ2YDR352W 954 nt6.33□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YDR476CYDR476C 675 nt6.32□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 AIM33YML087C 939 nt6.32□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YLL058WYLL058W 1728 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 NAF1YNL124W 1479 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 NFS1YCL017C 1494 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YDL177CYDL177C 513 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 URH1YDR400W 1023 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 NCA3YJL116C 1014 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 TPK1YJL164C 1194 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 ADE1YAR015W 921 nt6.31□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 TUB1YML085C 1344 nt6.3□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YMR034CYMR034C 1305 nt6.3□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YDR415CYDR415C 1125 nt6.3□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.3□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 KNS1YLL019C 2214 nt6.3□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 VBA5YKR105C 1749 nt6.3□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 SES1YDR023W 1389 nt6.3□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 MRP1YDR347W 966 nt6.29□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 ISC1YER019W 1434 nt6.29□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YSC83YHR017W 1158 nt6.29□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YUR1YJL139C 1287 nt6.29□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 SPG5YMR191W 1122 nt6.29□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 TOS6YNL300W 309 nt6.29□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 IRC11YOR013W 471 nt6.29□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 YPR204WYPR204W 3099 nt6.28□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 BIM1YER016W 1035 nt6.28□□□□□ -1.4
NEJ1Q06148 MIP1YOR330C 3765 nt6.27□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 CBR1YIL043C 855 nt6.27□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 COX5AYNL052W 462 nt6.27□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 YNL200CYNL200C 741 nt6.27□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 PTC7YHR076W 1032 nt6.26□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 ARG81YML099C 2643 nt6.26□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 PLB2YMR006C 2121 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 YPT1YFL038C 621 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 QCR6YFR033C 444 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 REC107YJR021C 945 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 RPL31BYLR406C 342 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 UBP13YBL067C 2244 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 HEM1YDR232W 1647 nt6.25□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 RGT2YDL138W 2292 nt6.24□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 BRN1YBL097W 2265 nt6.24□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 PMT3YOR321W 2262 nt6.24□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 NOG2YNR053C 1461 nt6.24□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 DPH5YLR172C 903 nt6.24□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 GPA1YHR005C 1419 nt6.24□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 DOC1YGL240W 753 nt6.23□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 NTG2YOL043C 1143 nt6.23□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 AVT4YNL101W 2142 nt6.22□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 YBR113WYBR113W 483 nt6.22□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 VMA2YBR127C 1554 nt6.22□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 CEF1YMR213W 1773 nt6.21□□□□□ -1.41
NEJ1Q06148 GET4YOR164C 939 nt6.21□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 DML1YMR211W 1428 nt6.21□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 HAL5YJL165C 2568 nt6.21□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 YHR020WYHR020W 2067 nt6.21□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 TKL2YBR117C 2046 nt6.2□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 ERG10YPL028W 1197 nt6.2□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 PAU21YOR394W 495 nt6.19□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 PAU22YPL282C 495 nt6.19□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 AIM3YBR108W 2844 nt6.19□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 PPM2YOL141W 2088 nt6.19□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 UTR2YEL040W 1404 nt6.18□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 EDE1YBL047C 4146 nt6.18□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 MRPS28YDR337W 861 nt6.18□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 ATG36YJL185C 882 nt6.18□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 FBA1YKL060C 1080 nt6.18□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 TOS1YBR162C 1368 nt6.18□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 MIA40YKL195W 1212 nt6.17□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 HTZ1YOL012C 405 nt6.17□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 STT3YGL022W 2157 nt6.17□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 FRE5YOR384W 2085 nt6.16□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.16□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 PEX13YLR191W 1161 nt6.16□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 YNR005CYNR005C 405 nt6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms