Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox10Q04888 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox10Q04888 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox10Q04888 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms