Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 ERG10YPL028W 1197 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 RFS1YBR052C 633 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 ALT2YDR111C 1524 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 RMD8YFR048W 1989 nt6.73□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 YDR327WYDR327W 327 nt6.73□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 LDB7YBL006C 543 nt6.73□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 BIO3YNR058W 1443 nt6.73□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 NAF1YNL124W 1479 nt6.73□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 RSP5YER125W 2430 nt6.72□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 MPA43YNL249C 1629 nt6.72□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 YBR284WYBR284W 2394 nt6.72□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 PXL1YKR090W 2121 nt6.72□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 POP1YNL221C 2628 nt6.72□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 PAB1YER165W 1734 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 CIA1YDR267C 993 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YOR300WYOR300W 309 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YPR076WYPR076W 375 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YPR130CYPR130C 408 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 CAN1YEL063C 1773 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 SGV1YPR161C 1974 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 MSS51YLR203C 1311 nt6.71□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 RQC1YDR333C 2172 nt6.7□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 GPD1YDL022W 1176 nt6.7□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 DPM1YPR183W 804 nt6.7□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 FLC2YAL053W 2352 nt6.7□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 MPH3YJR160C 1809 nt6.69□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 HIS7YBR248C 1659 nt6.69□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 GTT3YEL017W 1014 nt6.69□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 PDA1YER178W 1263 nt6.69□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 LIA1YJR070C 978 nt6.69□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YJL163CYJL163C 1668 nt6.68□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.68□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YGR127WYGR127W 939 nt6.68□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YHC3YJL059W 1227 nt6.68□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 HOC1YJR075W 1191 nt6.68□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 FCY22YER060W-A 1593 nt6.68□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 POR2YIL114C 846 nt6.67□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 RTC4YNL254C 1206 nt6.67□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 HTZ1YOL012C 405 nt6.67□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 COX15YER141W 1461 nt6.66□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 RRN10YBL025W 438 nt6.66□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YPL136WYPL136W 369 nt6.66□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 RPL43AYPR043W 279 nt6.66□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 SUN4YNL066W 1263 nt6.65□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YOL046CYOL046C 675 nt6.65□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 YCL049CYCL049C 939 nt6.65□□□□□ -1.34
RRN11Q04712 PLB2YMR006C 2121 nt6.65□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 ENB1YOL158C 1821 nt6.64□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 PPH21YDL134C 1110 nt6.64□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 MRPL35YDR322W 1104 nt6.64□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 THI4YGR144W 981 nt6.64□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 FPR2YDR519W 408 nt6.63□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 YGL260WYGL260W 231 nt6.63□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 FIT2YOR382W 462 nt6.63□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 HXT17YNR072W 1695 nt6.62□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 YKL147CYKL147C 618 nt6.62□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 YNR005CYNR005C 405 nt6.62□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 AGX1YFL030W 1158 nt6.61□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 CYC8YBR112C 2901 nt6.61□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 FCY2YER056C 1602 nt6.61□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 snR82snR82 268 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 CCP1YKR066C 1086 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 LOT6YLR011W 576 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 LIP5YOR196C 1245 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 AFG3YER017C 2286 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 APE4YHR113W 1473 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 FZF1YGL254W 900 nt6.59□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 AIM20YIL158W 615 nt6.59□□□□□ -1.35
RRN11Q04712 YFR006WYFR006W 1608 nt6.58□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YCR041WYCR041W 333 nt6.58□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YOL099CYOL099C 492 nt6.58□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 NUP57YGR119C 1626 nt6.58□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 IMG1YCR046C 510 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 SPG1YGR236C 288 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 MRPL19YNL185C 477 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 ASR1YPR093C 867 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 GAL83YER027C 1254 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 SNF4YGL115W 969 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YGR139WYGR139W 339 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YIL077CYIL077C 963 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 AIM2YAL049C 741 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YMR074CYMR074C 438 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 LAG2YOL025W 1983 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YNL200CYNL200C 741 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 EFT2YDR385W 2529 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 EFT1YOR133W 2529 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 OPI7YDR360W 435 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YLR184WYLR184W 348 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YOR012WYOR012W 414 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 CDC7YDL017W 1524 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 HDA1YNL021W 2121 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YEL020CYEL020C 1683 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 PMP3YDR276C 168 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 PAC10YGR078C 600 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YLR112WYLR112W 420 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 SMK1YPR054W 1167 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN11Q04712 YIL055CYIL055C 1884 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 YLL056CYLL056C 897 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 MRPS18YNL306W 654 nt6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.3 ms